Cuenta con calles empedradas y casas de techos de teja en colores pastel que frecuentemente se ven cubiertos de niebla.

Aquí puedes visitar el Templo de San Juan Bautista que cuenta con una peculiar torre. Al caminar por sus callejones puedes observar los vestigios de un convento franciscano y su tradicional Callejón del Beso.

No te puedes perder el Santuario del Peñón, edificado en una peña en donde de acuerdo a los lugareños se apareció la Virgen de Guadalupe. En la ladera en donde se construyó la iglesia aún se puede ver la imagen.

Puedes acceder al mirador Tonacatecutl que se ubica a una altura de 1020 m de altitud, tras una larga escalinata y un puente colgante. La panorámica es realmente espectacular, se dice que en los días claros es posible ver hasta el mar de Veracruz.

En sus alrededores se puede explorar Ecatlán, que se ubica a sólo 25 minutos de Jonotla. El camino esta rodeado de bosque tropical y puedes descender hasta el puente San Miguel que se ubica en medio de dos cerros que unen Jonotla con Cuetzalan. También se pueden visitar albercas naturales que forman el río Tozán y bañarse en medio de la naturaleza.

No dejes de adquirir algunas de las excepcionales artesanías del pueblo como troncos en forma de animales o las diversas piezas hechas con la fibra de jonote.