Zona Centro Semiárida

Con plantas de clima cálido seco y templado subhúmedo como matorral xerófilo y bosque tropical en donde se pueden contemplar agaves, cactáceas columnares, globosas y arbóreas.

Zona Sur

Con plantas de climas cálidos y secos en donde puedes ver casahuates, izotes, copales y huizaches, entre otras.

Plantas de Importancia Económica

Donde se pueden contemplar hortalizas, árboles frutales, medicinales y ornamentales.

Humedal de Temporal

Alberga plantas que se dan en la época de lluvias.

Palmetum

En donde se pueden ver diversas especies de palmas.

Vegetación Riparia

Es decir que es la vegetación que se da en los bancos de los ríos como ahuehuetes, tules y sauces, entre otras.

Quercetum

Ofrece árboles y arbustos del género Quercus como encinos y robles.

Hay otras secciones adicionales en donde se pueden admirar plantas silvestres y un importante Herbario que alberga la colección de más de 37,000 ejemplares, lo que la convierte en la más grande de Puebla.