La boca del estero es donde se abre paso el Mar de Cortés. Contrariamente a la vegetación típica del estado, el lugar está rodeado de un denso manglar. Cuenta con tres especies de manglares en donde habitan especies como el camarón café y azul, almejas, ostiones, mejillones y jaibas. 

El estuario es donde se encuentran el agua dulce y el agua salada y es el hábitat de más de 100 especies de aves diferentes. Es un lugar ideal para pasear en lancha o kayak.

El agua se mantiene a una temperatura fresca a pesar de tener una profundidad máxima de un metro. 

El estero constituye un sitio de refugio, anidación, alimentación y reposo por una gran cantidad de aves marinas, que pueden ser observadas especialmente en las tardes. Aquí puedes ver garzas, gaviotas y pelícanos. En verano se pueden ver más de 40 especies de aves, mientras que durante el invierno se han registrado hasta más de 100 especies de aves, ya que es un lugar en donde se establecen muchas aves migratorias.

Uno de los mayores atractivos del lugar es que está poblado por un cierto tipo de plancton con propiedades luminosas que se excitan con el movimiento, por lo que produce fosforescencias platinadas que durante las noches compiten con las estrellas. Es un excelente lugar para pescar.