Fue construido en 1847 por Fray Mariano Aguilera para jerarquía del convento de la Santa Cruz. Anteriormente, estos terrenos formaban parte del huerto del Convento de la Cruz.

Actualmente es el cementerio donde descansan Epigmenio González y don Ignacio Pérez y algunos otros personajes de la Independencia de México.

Justamente en el centro se ubica el Mausoleo de la Corregidora doña Josefa Ortiz de Domínguez, que comparte con su esposo don Miguel Domínguez.

Dentro del panteón se ubica la Capilla de la Virgen Dolorosa, patrona del panteón.