Este espacio fue ocupada por la primera Ermita fundada en Toluca por los misioneros franciscanos. 

En 1676 el templo pasó a manos de los Juaninos y se construyó un hospital anexo. En aquél entonces fue conocida como la Iglesia de San Juan de Dios.

Como resultado de la Leyes de Reforma los terrenos del convento y hospital fueron fraccionados y vendidos y en una de esas fracciones se construyó el Tribunal Superior de Justicia, mismo que fue demolido en 1968.

La iglesia es de estilo plateresco autóctono con una fachada compuesta de tres cuerpos y ricamente adornada con toda clase de motivos vegetales y geométricos.

En su interior la decoración es sencilla y se destaca el mural del altar principal en donde hay una bella imagen de la Virgen de Guadalupe.