Fue edificado por la orden de los juaninos que construyeron también un hospital en un terreno anexo.

Durante los movimientos independentistas, dos religiosos que habitaban en este convento, fray Luis Herrera y fray Juan Villanías, fueron participantes activos del movimiento.

Más tarde el hospital siguió con sus funciones pero únicamente dedicado a militares y después se convirtió en escuela. A principios del siglo XX fue totalmente renovado en un claro estilo neoclásico y en la actualidad alberga el Museo Federico Silva que exhibe esculturas contemporáneas.

Durante la época colonial llegó a albergar importantes y costosos ornamentos y lámparas.

Su fachada es sencilla, elaborada en mampostería que contrasta con su interior que ostenta un bello retablo principal.

Hay un magnífico mural de Fernando Leal elaborado en 1945 que decora la nave principal.

Frente al templo hay una agradable plaza.