Se edificó anexo al hospital de San Cosme y San Damián, conocido también Hospital Real.

La idea fue edificar un templo en donde los enfermos tuvieran un lugar para orar y oír misa.

A lo largo de los años el templo sufrió diversos daños por los terremotos y, poco antes de que entraran en vigor las leyes de Reforma, el hospital fue clausurado y vendido a particulares en 1860.

A fines del siglo XIX, el templo estaba en ruinas por lo que el arzobispo Gillow se propuso reconstruirlo.

En 1945 el edificio pasó a manos del estado y el templo, que por mucho tiempo estuvo cerrado, volvió a abrirse al culto.

El templo no posee atrio y su fachada simple se asemeja al conjunto de casas que lo rodean.