Éste es uno de los edificios más antiguos de la ciudad.

El inmueble que alberga al museo corresponde al Ex Cuartel de Ensenada, construido entre 1886 y 1887.

El objetivo del museo es conocer, conservar y difundir la historia de la región. Cuenta con exposiciones itinerantes y de piezas arqueológicas: Mesoamérica y Baja California, pueblos y culturas del México Antiguo. Se encuentra las exposiciones de “Cazadores y Recolectores del Mundo” y “Los Restos del Mamut.”