Se ubica en el Ex Convento de Santa Cruz de Santiago Tlatelolco.

El convento fue edificado con piedras del antiguo teocalli, en la parte posterior de la zona arqueológica.

Consta de dos niveles en donde se exhibe una selección de piezas arqueológicas, dentro de las que sobresale la vasija Tláloc hecha en madera.

Hay una Caja de Agua en donde se han conservado fragmentos de la pintura mural más antigua de la Nueva España en donde se muestra una escena de la vida cotidiana de los pobladores de los lagos de la cuenca de México en el siglo XVI.