Construido con domos de concreto que crean espacios circulares para cada una de sus diez salas.

Aborda temas como: astronomía, biología, geografía y la evolución del universo y del ser humano.

Cuenta con interesantes maquetas de diversos ambientes naturales. Una de sus principales atracciones es una extensa colección de insectos.

Integrado al museo se encuentra el Museo del Cárcamo de Dolores, inaugurado en 1951 para conmemorar los trabajos del Sistema Lerma en la Segunda Sección del Bosque de Chapultepec.

La obra es el resultado del trabajo conjunto del arquitecto Ricardo Rivas, el ingeniero Eduardo Molina Arévalo y el artista Diego Rivera.

Consta de un mural de más de 200 m2 pintado por Diego Rivera. En sus primeros años estuvo bajo el agua, lo que le daba un efecto muy especial, sin embargo a partir de 1992 los materiales comenzaron a dañarse y fue necesario realizar una restauración.

Esta parte del museo funciona como una sala interactiva que busca hacer conciencia sobre la cultura ambiental.

Se destaca del complejo es la maravillosa fuente de Tláloc que despliega una enorme escultura del dios mexica que sobresale del agua.