Fue fundada por los jesuitas en el siglo XVIII.

Se estableció en un lugar que los cochimíes llamaban Cadigoma que significa “Arroyo de Carrizales”. El encargado de la construcción fue el padre Javier Nicolás Tamaral que inició la construcción el camino que uniera ésta misión con la de San José Comondú en 1717.

La misión de La Purísima fue terminada en 1720 y fue dedicada a la advocación religiosa de Nuestra Señora de la Purísima Concepción.

El padre Tamaral junto con la misión creó huertos y sembró granos para alimentar a los nativos y personal que atendía la misión. 

Actualmente no queda más que unas cuantas piedras de la misión.