La primera piedra de la iglesia fue puesta en 1547 por Francisco Marroquín, obispo de Guatemala. 

La iglesia actual es al parecer del siglo XVII, pero en su construcción se aprovecharon elementos anteriores. 

El exterior ha sido modificado, pues al parecer la fachada estaba entre dos estructuras, de las cuales la sur ha desaparecido y sólo quedan evidencias de ella en la pared de la iglesia. 

La principal característica de la iglesia es su fachada, dispuesta como un gigantesco retablo de argamasa relacionado tanto a modelos guatemaltecos como oaxaqueños. Esta exquisitamente decorada y sobresale un gran escudo dominico. Los motivos de argamasa son diferentes y hacen de ésta una de las fachadas más ornamentadas del arte colonial mexicano y centroamericano. En la decoración se pueden descubrir ángeles, sirenas, y leones, entre otras figuras. 

El púlpito es de una belleza excepcional y esta labrado en una sola pieza de roble. Su estructura se levanta sobre un pedestal profusamente tallado y semeja un suntuoso cáliz de oro. Es uno de los mejores de México.