El edificio está conformado por un conjunto de casonas tradicionales ubicadas en el centro histórico de la ciudad de Colima.

Cuenta con once salas, de las cuales siete cuentan con exposiciones permanentes con obras de destacados artistas como el maestro Torres Quintero, Espinosa Chacón, Gerardo Murillo (Dr. Atl), Rafael Coronel, Fernando Best Pontones, Antonio Rodriguez Luna y los colimenses Jorge Chávez Carrillo, Javier Fernández, Carlos Escobar, Rafael Mesina, entre otros. El resto de las salas funcionan para exposiciones temporales.

En el centro del patio, existe un bello vitral policromado que representa al Volcán de fuego en erupción, cuya autoría corresponde al arquitecto Gonzalo Villa Chávez.

La pinacoteca tiene cafetería, biblioteca, sala de lectura y tienda de souvenirs.