Forma parte de las instalaciones de la Casa de la Cultura de la ciudad.

Es uno de los más importantes del occidente del país, por la cantidad y diversidad de piezas arqueológicas que exhibe.

El museo está dividido en dos grandes secciones, la primera está ubicada en la planta baja, que exhibe petroglifos y diversas piezas de cerámica. La segunda comprende las salas dedicadas a exhibir los avances o cambios culturales que tuvieron los pueblos de Colima a lo largo de su historia.

Cuenta con 11 salas de exposiciones permanentes en donde alberga una de las colecciones más significativas donada por la investigadora María Ahumada con más de 2300 piezas, incluyendo una de los objetos más significativos de Colima conocido como Perritos Bailarines.

También hay algunas salas de exposiciones temporales, tienda, servicio de visitas guiadas y estacionamiento.