Se inauguró en el año 2000 y el edificio fue diseñado en una rampa helicoidal de 2,200 metros cuadrados.

Cuenta con una exposición permanente de objetos representativos de la historia regional, que abarca desde la prehistoria hasta la segunda mitad del siglo XX.

El museo también ofrece una sala de exposiciones temporales.

Se ubica dentro del Centro Cultural Tijuana, CECUT, el cual también es el hogar de la Orquesta de Baja California, de un Cine Omnimax, un teatro, una librería y una cafetería.