La iglesia era de adobe y con un techo de paja, a la cual se le conoció como “Las Lágrimas de San Pedro”.

En 1862 la ermita fue arrasada por un incendio y fue reconstruida. Desde sus inicios estuvo destinada a la población nativa oaxaqueña.

Cuando el templo fue dedicado a la Virgen del Carmen, empezó a llamarse “El Carmen de Abajo”, para diferenciarla del templo del Carmen Alto, que pertenecía a los feligreses de la nobleza colonial de Antequera.

La fachada es sencilla y el templo es en forma de cruz latina. Cuenta con una nave cubierta con bóveda de cañón corrido con algunos tragaluces. Tiene dos capillas, algunos locales y dos pequeños atrios.

En su interior el templo conserva retablos del siglo XIX y algunas pinturas de principios del siglo XX.