Fue construido en 1696 por los franciscanos y se dedicó a San Lucas, el apóstol médico.

El Santuario del Señor del Calvario fue levantado sobre los basamentos de un centro ceremonial prehispánico.

El conjunto consta de un pequeño atrio y un pequeño templo de estilo neoclásico.

La mayor parte de los elementos que se encuentran en su interior provienen del siglo XIX.

En la parte posterior del templo se encuentran algunos vestigios arqueológicos.