Este lugar fue utilizado como alhóndiga y cárcel.

En 1871 se le colocó el reloj que fuera el primero de la ciudad de Mérida. Al paso del tiempo ha sufrido varios cambios, la torre se construyó hasta 1928 y el pórtico de piedra de la entrada principal pertenecía a una casa colonial y se instaló en el Palacio Municipal en 1949.

En el salón de los cabildos se puede admirar una pintura al fresco que representa una alegoría del mestizaje.