Cuenta con 8 diferentes salas.

En las salas se narra la historia de la región, comenzando con los grupos étnicos, siguiendo con la fundación de la ciudad de Compostela y hasta la era contemporánea.

Se destacan la de “El Agave Azul” que muestra el proceso del tequila y su historia y la sala de la Conquista, que narra sobre los grupos indígenas que habitaron Guadalajara.