Se ubica en el antiguo Colegio de San Francisco Xavier, recinto que fue totalmente rehabilitado.

Cuenta con un área de 2,200 metros cuadrados en donde se hace un recorrido de la historia militar, desde la época prehispánica hasta los tiempos actuales.

Consta de 15 salas, 14 permanentes y una dedicada a exposiciones temporales.

Los temas que aborda son: historia del conjunto arquitectónico, el Guerrero Prehispánico y la Conquista, las Milicias Virreinales, el Movimiento de Independencia, el Ejército Liberal, la Revolución y el nacimiento del Ejército Mexicano, entre otros.