El museo se aloja en el antiguo Convento de la Purísima Concepción de la Orden de los Carmelitas Descalzas que data del siglo XVIII.

Se compone de un corredor, un patio, tres salas de exposición temporal y siete salas en las que se muestran pinturas del Virreinato (siglos XVI-XVII), obras de pintores europeos, esculturas en madera policromada y estofadas del siglo XVIII y obras pictóricas del siglo XIX, mostrando así la museografía adecuada al inmueble.

Dentro de todos los objetos en exhibición se destaca el Túmulo Funerario o Catafalco que tiene una forma piramidal con cuatro niveles. Cuenta con 16 paneles pintados al óleo en donde su muestran diversas ceremonias relacionadas con la muerte, data del siglo XVIII y hay muy pocos como este en todo Latino América.