Se aloja en una casa del siglo XVIII que tiene un gran valor histórico y arquitectónico.

Su exhibición consta de obras del virreinato, documentos, libros antiguos, ornamentos religiosos, mapas de época, pinturas, piezas de madera policromada y cristos de pasta de caña de maíz que datan de la época de la evangelización.

Sobresalen dos colecciones, una de pinturas de caballete de la época colonial firmadas por los afamados artistas oaxaqueños Miguel Cabrera y Miguel Herrera; y una colección de más de cien Cristos fabricados entre los siglos XVI y XIX.