Este museo esta dedicado a narrar la historia del maíz.

También nos habla de como su evolución e importancia en la sedentarización en Mesoamérica y el papel preponderante que ha jugado en todas las culturas de la región.

Cuenta con tres salas, la primera habla de la historia de las investigaciones realizadas en la región y en ésta se destacan piezas como una urna Mixteca que tiene un gran tocado en donde se distingue la figura de Tláloc.

La segunda sala está dedicada al maíz y el papel que ha jugado en la historia de Tehuacán. Llama la atención un gran mural elaborado con semillas de maíz de diferentes tipos y colores en donde se retrata a Xilonen, la diosa del maíz tierno y joven.

Y la tercera sala está dedicada a exhibiciones temporales.

Dentro de su exhibición destacan algunas milenarias y minúsculas mazorcas que han sido encontradas en el Valle de Tehuacán y una gran variedad de piezas prehispánicas como vasijas, platos, collares de cuentas y piedras para moler, entre otras muchas otras.

También hay restos de osamentas humanas, información sobre sitios arqueológicos de la región que todavía no están abiertos al público, mapas y láminas.