Se aloja en un edificio de la época porfiriana en medio de bellos jardines.

La construcción se ubica cerca de los vestigios de lo que fuera un asentamiento de la cultura náhuatl.

Cuenta con dos salas en donde se puede observar una colección de más de 2400 piezas prehispánicas, tanto de barro como de piedra. Se destaca una piedra-mapa de Cuahilama, en la cual se pueden ver los templos, canales y manantiales de la zona.

Dentro de su exhibición también se encuentran los restos de mamuts y otros fósiles de la época del pleistoceno.