Construida entre 1671 y 1696, su fachada es de estilo barroco y es uno de los edificios más representativos de la ciudad. 

Su construcción estuvo patrocinada por los mineros de la zona y cuenta con tres accesos, un campanario de tres cuertos y otro más pequeño también de estilo churrigueresco.

En el interior se puede admirar la antigua figura de la Virgen Patrona de la Ciudad que fue obsequio del Rey Carlos I y su hijo Felipe II de España en el año de 1557, como gesto de gratitud por la infinita riqueza minera de Guanajuato. La imágen esta colocada en el bello altar mayor totalmente dorado junto con las imágenes de San Ignacio de Loyola y la escultura de la Fe, ya que el nombre original de Guanajuato era Real de Minas de Santa Fe.

Esta imagen de la Virgen fue coronada en ceremonia pontificia como reina de Guanajuato el 31 de mayo de 1908.

También se destaca el órgano tubular de estilo barroco francés que esta compuesto de 1,098 tubos.